Nieuszkodzone termometry należy oddać w aptece, najlepiej w pudełku, w którym były do tej pory przechowywane. Uszkodzone termometry rtęciowe (zarówno rtęć jak i szkło) należy przed oddaniem ostrożnie umieścić w szczelnym naczyniu wypełnionym wodą (np. słoik typu twist).
Zgodnie z ustawą o odpadach z dnia 27 kwietnia 2001 r., odpady zawierające rtęć zaliczone są do kategorii odpadów niebezpiecznych. W związku z tym, powinny być oddawane do specjalnych punktów zbierania. Wyrzucając termometr rtęciowy do śmietnika stwarzamy bezpośrednie zagrożenie dla środowiska naturalnego. Rtęć z uszkodzonych termometrów łatwo przenika do gleby, powietrza oraz wód gruntowych i w konsekwencji zanieczyszcza środowisko naturalne, stwarzając tym samym zagrożenie dla zdrowia ludzi i zwierząt.